A pesar de que Lanegan no suele hablar sobre su infancia, se sabe que viene de una famillia marcada por las continuas discusiones entre sus padres, que acabaron divorciándose, originando un ambiente no muy favorable para su educación, lo que le indujo a meterse en el mundo de las drogas desde la temprana edad de 18 años, llegando incluso a permanecer en prisión durante un año a causa de delitos relacionados con las drogas. Después e esto, Lanegan estuvo un año en un proyecto de desintoxicación.